1、降低了换热效果   
碳酸盐水垢的导热系数，只有碳钢的1%左右，铜的1/300-1/400，由此可见，水垢或其他沉积物的导热系数比金属低的多，因此当水垢或其他沉积物覆盖在换热器的换热表面时，就会大大降低换热器的换热效率。

2、使循环水量减少   
沉积物或微生物黏泥覆盖在换热器中的换热管壁甚至堵塞换热管，使得循环水通道的截面积和流量变小，从而使换热效果进一步降低。

3、降低了水处理药剂的使用效果   
沉积物以及微生物黏泥覆盖在金属表面，阻止了水中的缓蚀剂、阻垢剂和杀菌剂等水处理药剂到达金属表面发生缓蚀、阻垢和杀菌作用，并且会有些微生物还会和一些水处理药剂发生反应，从而破坏和降低了这些药剂的使用效果。

4、加速了腐蚀   
沉积物和微生物的产生，促使了浓差腐蚀电池的形成及垢下腐蚀的产生，从而使金属的腐蚀速度加剧。

5、缩短了设备的使用寿命   
一方面，沉积物和微生物黏泥等覆盖在换热器表面，阻止了设备的有效换热，从而使换热表面的金属长期处于高温热负荷状态，导致金属疲劳；另一方面，腐蚀的发生会导致设备如换热器的换热管管壁变薄，尤其是垢下腐蚀还会导致设备穿孔泄漏。这些情况的发生，使得设备的使用寿命被缩短。

6、增加了运行成本  
为使设备保持足够的换热效率，必须采取诸如增加水量等措施，使电、燃料等成本增加，同时为维修因腐蚀等原因造成设备损坏等，必然需增加一些费用，从而增大了设备的运行成本。